À Mayotte, un partenariat inédit au service du lagon, des populations et des écosystèmes côtiers

Ce lundi 8 juin 2026, lors de la Journée mondiale de l’océan, l’Agence française de développement, le ministère des Outre-mer, la Fondation Aga Khan et l’Ismaïli Imamat ont signé un protocole d’accord ouvrant une nouvelle coopération en faveur de Mayotte. C’est le premier partenariat de la Fondation Aga Khan pour un territoire français.

Organisée en présence du prince Aly Muhammad Aga Khan, de la ministre des Outre-mer Naïma Moutchou et du directeur général de l’AFD Christophe Lecourtier, cette signature marque une nouvelle étape du partenariat entre l’AFD et la Fondation Aga Khan, dans un contexte où le territoire mahorais fait face à d’importants défis environnementaux, économiques et sociaux, notamment à la suite du passage dévastateur du cyclone Chido fin 2024. Elle illustre aussi les efforts accrus des acteurs du développement en matière de protection des océans, dans la continuité de la conférence Unoc-3 de Nice en juin 2025.

Le protocole signé à Paris pose les bases opérationnelles d’un projet ambitieux de protection du lagon mahorais, de restauration des écosystèmes côtiers et de renforcement de la résilience du territoire et de ses populations face aux pressions environnementales.

La protection du lagon mahorais

L’île de Mayotte, 101^e département français, est en effet l’un des cinq « points chauds » français de la biodiversité mondiale. Elle a la particularité d’être entourée d’une vaste barrière de corail qui est à l’origine du complexe récifo-lagonaire le plus vaste de la partie occidentale de l'océan Indien : 1 100 km² et 40 mètres de profondeur en moyenne. Le lagon de Mayotte attire une faune exceptionnelle et constitue un patrimoine naturel unique autour d’écosystèmes côtiers et marins remarquables : récifs coralliens (frangeant, interne et barrière), îlots de forêt sèche, herbiers et mangroves.

L’objectif est de soutenir une gestion plus durable de ce patrimoine à travers une approche intégrée reliant espaces marins, littoraux et terrestres. Il s’agit ainsi de renforcer le « continuum terre-mer ».

La première phase du projet, prévue sur quatre ans (2027-2030), s’appuiera sur trois axes principaux : la préservation du lagon et de ses ressources, la restauration des mangroves et zones littorales tampon, ainsi que le développement de pratiques agricoles plus durables à travers l’agroécologie et l’agroforesterie. Elle viendra en complémentarité de la Stratégie quinquennale pour la reconstruction et le développement de Mayotte, qui a suivi le cyclone Chido, pilotée par la Mission interministérielle de reconstruction et de refondation de Mayotte.

Parmi les actions envisagées figurent le suivi de la qualité de l’eau, le soutien à une pêche plus durable, la restauration écologique des mangroves, la réduction des phénomènes d’érosion, l’accompagnement des agriculteurs ou encore le développement d’outils de sensibilisation et de gestion participative.

L’un des objectifs spécifiques du programme sera également de contribuer aux conditions permettant le classement de la double barrière de corail de Mayotte au patrimoine mondial de l’Unesco.

8,5 millions d’euros sont apportés par la Fondation Aga Khan pour cette première phase du projet, dont le lancement est envisagé début 2027.

Avec les acteurs locaux

La mise en œuvre du projet réunira trois opérateurs publics : le Parc naturel marin de Mayotte, le Conservatoire du littoral et l’Établissement public de refondation et de développement de Mayotte. Les associations locales, très actives en matière d’environnement, seront aussi associées au projet. La mobilisation d’une assistance technique de la Fondation Aga Khan est également prévue, notamment en matière d’agroécologie.

« Pour la première fois – et forts de trente-cinq ans de partenariat en Afrique et en Asie – le réseau de développement de l’Aga Khan et l’AFD unissent leurs forces au service d’un département français, Mayotte. Après le passage du dévastateur cyclone Chido, nous sommes engagés ensemble pour soutenir les territoires les plus vulnérables, mettre en commun nos expertises et ressources pour l’archipel, ses populations et la protection de son lagon », souligne Christophe Lecourtier, directeur général de l’AFD.

Une nouvelle étape à Mayotte

Pour l’AFD, ce partenariat illustre une évolution des modes d’intervention dans les territoires ultramarins, où la mobilisation conjointe d’acteurs publics, de partenaires du développement et d’acteurs de terrain apparaît de plus en plus nécessaire pour répondre à des défis complexes.